El modelo pedagógico del programa se manifiesta esencialmente a través de una relación horizontal bidireccional entre docentes y estudiantes, y multidireccional en la relación con el contexto. La participación activa de los estudiantes y la mediación del docente en los ambientes de formación les permite vivenciar un proceso de comprensión y aprendizaje alrededor de objetos de conocimiento científico diverso, donde la principal intención es la búsqueda de sentido en la construcción de saberes aplicables al análisis y solución de situaciones problémicas identificadas en el contexto educativo, siempre mediante la producción de documentos, material audiovisual, software u otros artefactos tecnológicos, que se convierten en las evidencias de aprendizaje que los docentes valoran para evaluar su avance en la ruta de formación propuesta.

En el Modelo pedagógico tiene claramente definidos los siguientes aspectos: Fundamento teórico del modelo, las metas de formación, competencias, contenidos, metodologías, roles de estudiantes y docentes y el proceso de evaluación entre otros.