El programa de Bacteriología, promueve y desarrolla la cultura investigativa en sus docentes y estudiantes, teniendo en cuenta las políticas institucionales de investigación establecidas en el Acuerdo 022 del 21 de febrero de 2018, por el cual se “Reglamenta la Administración de la Investigación en la Universidad de Córdoba” y lo señalado en la Res. 007/2008 por la cual se reglamentan las modalidades de trabajo de grado en los programas de pregrado de la Universidad de Córdoba. Estas políticas institucionales de investigación se encuentran, acordes con las políticas nacionales lideradas COLCIENCIAS.
En el programa de Bacteriología la investigación es promovida a partir de la Investigación formativa en el aula (en el plan de estudios y por los cursos propios de investigación: Metodología de la Investigación I y II, y Trabajo de Grado) y mediante los semilleros de investigación, en sentido estricto a través del desarrollo de proyectos de investigación liderados por profesores del programa categorizados en Colciencias y jóvenes investigadores del grupo de Investigaciones Microbiológicas y Biomédicas de Córdoba GIMBIC, el cual tiene el objeto de realizar estudios en las áreas microbiológica y clínica, centrada en la problemática regional y nacional, para dar solución a los principales problemas de salud que afectan el entorno.