El Plan de Estudios conformado por 56 cursos distribuidos en 10 semestres académicos, complementados con el desarrollo de laboratorios y prácticas de campo, conforme a las áreas del conocimiento dispuestas en el Decreto 2566 de 2003 y la Resolución 2773 de noviembre 13 de 2003.

Las cuatro áreas de conocimiento que conforman la estructura curricular del Programa de Ingeniería Ambiental son: Área Básica, Área de Básicas de Ingeniería, Área de Ingeniería Aplicada y Área de Formación Complementaria.

El Programa incorpora el componente de flexibilidad mediante electivas, los cuales le dan la oportunidad al estudiante de elegir entre una variada oferta de cursos libres, de carrera y de profundización; además de cursos como seminario de investigación y Trabajo de Grado en el X semestre

La malla curricular tiene un componente de 37 créditos flexibles equivalentes al 22,7%, incrementado a partir de abril del 2008, fecha en que la Universidad aprobó siete (7) opciones de trabajo de grado para optar al título profesional tales como: Trabajo de investigación y/o Extensión, Creación de empresa, Práctica empresarial, Pasantía, Diplomado, Monografía y aprobar un semestre de posgrado en la Institución.